Antes de mais, é necessário entender alguns conceitos utilizados pelo EmissorFiscal:

Produtos não igualados – produto do fornecedor que que ainda não foi equiparando a um já existente em Produtos/Serviços > Produtos;
Produtos desligados – produto do fornecedor que mesmo já estando igualado a um existente em estoque, ainda não está a ele ligado para efeitos de contagem de estoque. Apenas produtos ligados incrementam automaticamente a quantidade em estoque ao darem entrada por um documento de compra;
Produtos ligados – produto de um fornecedor que além de igualado a um já existente, está também a ele ligado para efeitos de contagem de estoque;
CFOP indefinido – produto em que o CFPO de compra/entrada, ainda não foi definido.

Nas NF-e de compra, em Compras > NF-e > botão Ações > Visualizar, abra uma NF-e para consulta.

Na NF-e de compra com a opção de Filtro, visualize apenas os produtos que requerem da sua atenção e necessitam ser modificados.

Depois de filtrados e com o botão de Ações será possível individualmente, Cadastrar o produto, Igualar, Ligar ao Estoque ou definir o CPOP de compra.

O procedimento explicado nesta FAQ permite facilmente :

Definir o CPOP de compra – selecione a opção Códigos Tributários e escolha o código CFOP pelo qual o produto está dando entrada.

Cadastrar Produto – selecione o grupo onde o software devera criar um novo produto tendo como base para o seu cadastro os dados contidos no XML da NF-e de compra.

Igualar produto – selecione um produto já existente/cadastrado no estoque ao qual vai igualar o recebido nesta NF-e. Ao efetuar este procedimento e em futuras NF-e recebidas deste mesmo fornecedor o produto será automaticamente Igualado pelo EmissorFiscal.

 O Fator Multiplicador serve para multiplicar a quantidade recebida e obter a que vai ser adicionada no estoque.

Ligar ao Estoque – só pode ser efetuado para produtos que já se encontrem igualados. Uma vez um produto ligado ao estoque e sempre que este for recebidos em futuras NF-e, oriundas deste mesmo fornecedor, ele será automaticamente adicionado ao estoque.

Consulte também as seguintes FAQ:

Como configurar o software para dar entrada no estoque automaticamente pela NF-e de compra?